プロポリスをミツバチが採取して使用するには、ミツバチの巣に適した多くの理由があります。ミツバチはプロポリスを巣板や巣の周囲の壁に塗りつけて、巣の防水性を高め、巣内の温度を一定に保つために使用したり、巣内を衛生的な環境に保つために用いています。
プロポリスを巣内のひび割れ・でこぼこなどの修復にも使用します。巣にプロポリスを塗ることによって狭い隅や隙間に微生物が繁殖するのを防止することができるのです。プロポリスを塗り巣の出入り口を狭めて外敵の侵入を妨げたり、ミツバチの出入りがしやすいように通路をなめらかに整えたりするためにも使用します。
蜂児巣房に女王蜂が卵を産む前には、あらかじめ巣房の内側にプロポリスを塗りひろげたりもします。プロポリスに含まれる揮発性の精油は，巣内の消毒に役立っているという意見もあるのです。
